Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1P56716 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rp1P56716 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rp1P56716 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms