Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms