Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cox7bP56393 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox7bP56393 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms