Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aqp4P55088 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Aqp4P55088 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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