Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NrlP54846 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrlP54846 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrlP54846 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrlP54846 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms