Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PctpP53808 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PctpP53808 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PctpP53808 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms