Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fdft1P53798 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fdft1P53798 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms