Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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