Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SftpdP50404 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpdP50404 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms