Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cav1P49817 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cav1P49817 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms