Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Epb41P48193 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epb41P48193 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Epb41P48193 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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