Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scg3P47867 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg3P47867 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg3P47867 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms