Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rph3aP47708 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rph3aP47708 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rph3aP47708 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rph3aP47708 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rph3aP47708 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rph3aP47708 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3aP47708 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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