Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.2 ms