Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tac1P41539 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms