Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn1P35821 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn1P35821 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms