Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptk2P34152 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms