Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms