Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms