Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RxrbP28704 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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