Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col2a1P28481 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms