Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Etv4P28322 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Etv4P28322 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Etv4P28322 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Etv4P28322 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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