Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjc1P28229 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms