Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PdgfraP26618 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms