Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnd1P25322 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms