Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdk11bP24788 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk11bP24788 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms