Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klra1P20937 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klra1P20937 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms