Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VimP20152 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VimP20152 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VimP20152 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VimP20152 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VimP20152 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms