Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms