Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18526 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18526 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18526 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms