Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb1P17919 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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