Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcp1P11983 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcp1P11983 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcp1P11983 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcp1P11983 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcp1P11983 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcp1P11983 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcp1P11983 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcp1P11983 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcp1P11983 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcp1P11983 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcp1P11983 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcp1P11983 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tcp1P11983 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms