Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa1P11477 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms