Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolP11369 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PolP11369 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolP11369 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolP11369 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolP11369 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PolP11369 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PolP11369 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PolP11369 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms