Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nid1P10493 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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