Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tmem254bP0DN90 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem254bP0DN90 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms