Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Psmg4P0C7N9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmg4P0C7N9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms