Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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PtprqP0C5E4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
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PtprqP0C5E4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PtprqP0C5E4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PtprqP0C5E4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PtprqP0C5E4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PtprqP0C5E4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PtprqP0C5E4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprqP0C5E4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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