Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd4P06332 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms