Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms