Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01823 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01823 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01823 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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