Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01679 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01679 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01679 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
P01679 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01679 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01679 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01679 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01679 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01679 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01679 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01679 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01679 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01679 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01679 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01679 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01679 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01679 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01679 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01679 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01679 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01679 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01679 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01679 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms