Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JtbO88824 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JtbO88824 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
JtbO88824 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JtbO88824 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JtbO88824 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JtbO88824 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JtbO88824 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
JtbO88824 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms