Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AurkcO88445 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AurkcO88445 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AurkcO88445 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms