Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnnal1O88327 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnnal1O88327 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms