Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms