Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tlx3O55144 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tlx3O55144 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tlx3O55144 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tlx3O55144 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tlx3O55144 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tlx3O55144 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tlx3O55144 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms