Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dsg2O55111 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms