Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syngr1O55100 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms