Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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